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Re-Evaluation of Vascular Histogenesis in the Root Tips of Selected Species in the Poaceae Using New Methods: Analysis of the Plerome, Vascular Initials, Pericycle and Late-Maturing Metaxylem Vessels

Yasushi Miki, Susumu Saito, Teruo Niki and Daniel K. Gladish

Plants 2024, 13(6), 910; https://doi.org/10.3390/plants13060910

Figure 9. Characteristics of the primary root tip procambia of four taxa (1–4) in the Poaceae as seen in enhanced section images and 3D constructions. (A) Views of the basipetal face of the vascular initials layers, (B) oblique perspective of 3D constructions of the central initials and plerome cells (shades of green), (C) transverse images of the VC at 100 µm from the RCJ, and (D) 3D images from the primary root tips of the LMX(s) and two pericycle cell files associated with their plerome and vascular initials layer. Scale bar = 50 µm.

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Improved image processing for 3D virtual object construction from serial sections reveals tissue patterns in root tips of Zea mays

Yasushi Miki, Susumu Saito, Teruo Niki and Daniel K. Gladish

Applications in Plant Sciences, vol. 11, July 2023

https://doi.org/10.1002/aps3.11531
Figure 6
Generating a virtual 3D object. (A) An original colorized image. (B) Image after the color exchange procedure. White and GreenYellow colors were changed to Black to make them transparent. (C) Virtual 3D object constructed with use of “3D Viewer” in ImageJ.
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連続薄切片とPCを用いた組織細胞の形態観察法

仁木輝緒・幹 康・斎藤 進

ミキ音響イメージプロセッシング部門

日本植物学会第86回大会（2022年9月17–19日，京都）

生物・医学の研究において、３Dイメージ像の作成は組織・細胞の形態解析に有用である。連続薄切片で２次元像、３次元像の構築には、クリヤーな画像データが大量に必要である。　この目的に、かなう簡便な切片作成法（Niki et al 2019）、および２次元、３次元の像構築法（Miki et al 2020）を紹介する。

試料を、ホルマリン水溶液で固定、洗浄・脱水後テクノビット７１００樹脂に包埋した。１µm連続切片を作成。切片を（RNA分解）酵素処理によって解像性、コントラストとも満足する像を得る。トルイジンブルー染色し、観察・収得画像とする。

得られた各画像の組織・細胞群等の各種処理については画像処理ソフトImageJ, GIMPを利用した．輪郭処理はImageJのツール「Find Maxima（分水嶺法）」を行い、目的とする組織・細胞群にはGIMPを利用して任意の着色を行う。また、各画像の位置合わせも行う。さらに、ImageJ を使用して組織・細胞の２Ｄ像、３Ｄ像を構築する。

ImageJのプラグイン「Volume Viewer」、「3D Viewer」による像構築では、組織・細胞の種々の角度での像、目的細胞群のつながり状態、動画等の作成・観察が可能となる。それらの実例を示す。

本研究法は高価な研究資材・装置を求めることなく、安価で簡便に構造解析が行える手法である。